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一种方法是靠潮差成使用动力纳入的海水，此类海水由于海区污染日益严重，海水中多含有细菌、病毒和有害化学物质，应先经蓄水池处理后再进水。
另一类是直接抽取地下水，可避免带入病原，但不同地区地下水的化学成份有所不同。
如果该地区的地下水中氨氮、亚硝酸盐或硫化物含量较高，一定要经过处理后方可入池，否则会影响对虾的成活率和生长速度。
其处理方法为充分曝气，加大增氧量，并结合使用光合细菌、硝化细菌等微生物制剂处理。在兑淡养殖区，同样应注意淡水水源的污染情况。
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